Та-даа – вот он: карта всего генома свиньи. Сотрудничество между исследовательскими группами из Орхусского университета и большим количеством других университетов и научно-исследовательских институтов со всего мира привело к последовательности и описанию всего генома свиньи. Результаты опубликованы в научном журнале Nature.
Речь идет о понимании генома во всей его полноте, с тем чтобы его впоследствии можно было использовать как в исследованиях, так и в селекции, – говорит профессор исследований Кристиан Бендикен, который возглавляет одну из исследовательских групп в Орхусском университете, которая участвовала в проекте.
Геном свиньи – это весь генетический код – своего рода план для свиньи. Имея подробную информацию о геноме, ученые получат лучшее представление о родословной свиней и истории и почти бесконечном числе факторов, которые могут повлиять на здоровье, болезни и производственные характеристики свиней.
Подробные знания о геноме свиньи также представляют особую помощь и важный инструмент для исследователей, которые используют свиньи в качестве модели болезней человека, что является одной из областей, в которой исследователи из Орхусского университета также преуспевают. Свиньи уже используются для исследования наследственных заболеваний, таких как болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, моторные нейроны, сердечно-сосудистые заболевания, диабет, псориаз и рак.
Профессор в области медицинской генетики Ларс Болунд, который является одним из инициаторов проекта, также участвует в развитии частной китайской некоммерческой исследовательской организации Beijing Genomics Institute (BGI), которая провела множество генетических отображение теперь опубликовано в Nature. Параллельно с этой работой BGI и Lars Bolund также провели сравнительное исследование генетического материала медицинской интересной инбредной китайской мини-свиньи У Чжи Шаня. Эта работа была опубликована в научном журнале GigaScience одновременно с статьей Nature.
Исследователи из Орхусского университета также активно участвовали в секции работы, которая включала секвенирующие гены – аннотацию молекулярной последовательности – более 21 000 белок-кодирующих генов.
Они также помогли описать миллионы генетических вариантов, которые можно найти в геноме. Эта работа позволит исследователям лучше понять историческое развитие свиньи, функцию конкретных генов и то, как гены влияют на характеристики свиней, такие как устойчивость к заболеваниям, качество мяса или эффективность использования корма.
– Данные из очень длинных и очень обширных исследований из исследовательского консорциума теперь свободно доступны и могут использоваться исследовательскими сообществами где угодно, – говорит Кристиан Бендикен.
Датская часть работы по картированию генома свиньи финансировалась, среди прочего, научно-исследовательскими советами, Фондом передовых технологий и Исследовательским центром свиней.